Мендельсон опублікував свої Шість органних сонат, ор. 65 у 1845 році. Він здобув репутацію гравця на органі завдяки своїм навичкам імпровізації та чудовому виконанню музики Баха. Ці якості стали очевидними в органних сонатах, які були замовлені англійськими видавцями Coventry and Hollier у 1844 році як «набір добровільних творів». Початкове оголошення видавця називало цей твір «Школою гри на органі» Мендельсона, але цю назву було скасовано. за бажанням композитора. Використання терміна соната, коли мова йде про ці твори, стосується не класичної сонати, а сонати в розумінні Баха: збірки або сюїти різних творів. Сонати містять посилання на низку хоралів Баха. Це технічно складні твори, і орган повинен бути у відмінній формі, щоб можна було виконувати їх правильно. Сам Мендельсон відхилив запрошення зіграти сонати під час візиту до Англії, аргументуючи це тим, що орган був занадто важким.
