In zijn latere jaren wendde Beethoven zich, net als veel andere componisten, tot de muziek van JS Bach voor nieuwe ideeën. Beethovens bewondering voor de late barokmeester begon echter al toen hij nog in Bonn was. Mogelijk als eerbetoon aan Bachs preludes en fuga's in elke toonsoort, componeerde Beethoven twee Preludes, waarbij beide gebruik maakten van elk van de twaalf majeurtoonsoorten. Dit zijn minder succesvolle werken dan zijn latere contrapuntische meesterwerken, zoals de Pianosonate nr. 28, Op. 101, het eerste deel van het Strijkkwartet, Op. 131, en de Grosse Fuge, Op. 133. Het is mogelijk dat Beethoven de Preludes, Op. 39, als compositieoefeningen voor zijn leraar, Christian Gottlob Neefe (1748-1798). De Preludes werden in 1803 uitgegeven door Hoffmeister en Kühnel in Leipzig.