Gerardo Aponte inició sus estudios musicales en el programa de Orquestas y Coros Juveniles de México en 1992, permaneciendo en este programa hasta 1994. Continuó sus estudios de forma privada y ha sido profesor de Lech Kwapisz, Jan Sosnowsky, Mikhail Tolpigo y Manuel Suárez entre otros. Tomó clases de composición con Salvador Rodríguez. Ha sido violista en muchas de las orquestas más importantes de México como la Orquesta Sinfónica Nacional (OSN). En el ámbito de la música de cámara ha sido miembro del Cuarteto de Cuerdas Silvestre Revueltas, Ensamble Permutaciones y Tempus Fugit.